Le conditionnement primaire est le début de la préparation du médicament à sa sortie de l'usine. C'est une série d'opérations comme la mise en sachet pour la poudre ou en pilulier pour les pilules.

Tout cela est fait sous une atmosphère controlée par une centrale de traitement d'air afin que les médicaments soient au final contenus dans un environnement saint.