Les vaccins bactériens ont eux aussi leur propres tests:

- Culture bactérienne 

- Test d'activité in vivo (tétanos, coqueluche)

- Test in vitro de toxicité, d'identité et de suivi de production (tétanos, coqueluche) 

- Méthodes physico-chimiques (quantification des polyosides par méthodes chromatographiques, colorimétriques, néphélométriques..)